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メチオニンの代謝によって合成されて、ポリアミンやシステインの原料となる有機化合物。活性型メチオニンとも呼ばれる。抗炎症活性を持ち、慢性肝炎の治療に用いられる。タンパク質やDNAなどのメチル化におけるメチル基の供与体としての役割も持つ。S-アデノシルメチオニンはメチル基転移酵素にメチル基を与える補酵素となり、自身はS-アデノシルホモシステインに変化する。アミノ酸の代謝やホスファチジルコリンのde novo合成などで働く。

エリオシトリンの代謝産物のひとつ。エリオジクチオールのメチル化誘導体。

シリング酸のカルボキシル基がメチル化した芳香族化合物。マヌカハニーに含まれる。レプトスペリンのアグリコン。カルボキシルエステラーゼ（CES1）によってメチルシリンゲートのメチルエステルが切断されシリング酸を生じる。

アントシアニジンの一種。マルビジンの5位がメチル化した構造を持つ。天然に存在し、紫色を呈する。

タンパク質中のトリプトファンが腸内細菌により代謝されて生じる芳香族化合物。インドールのメチル化誘導体であり、3-メチルインドールとも。糞便に含まれ、悪臭がある。動物実験では、スカトールの摂取により大腸においてデオキシコール酸の産生の増加、PPARγの発現低下、糞便中インドール濃度の増加を引き起こすため、炎症性腸疾患や大腸がんの一因となる可能性が示唆されている。

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