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マラリア原虫や植物の色素体がステロイドやビタミンAなどのイソプレノイドの生合成を行う際の代謝経路。この経路においてイソプレノイドはイソペンテニル二リン酸の縮合によって生成される。非メバロン酸経路とも。ホスミドマイシンによって阻害される。カロチノイドやフィトールなどの生合成を主とする。一部の中間代謝産物をメバロン酸経路と交換している。

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