モチーフ（motif） †
タンパク質を構成するアミノ酸配列における定型的なパターンのこと。超二次構造とも呼ばれる。*1
ジンクフィンガー（亜鉛フィンガー）やロイシンジッパーは代表的なDNA結合タンパク質の構造モチーフ。*2
モチーフとは各種のタンパク質のアミノ酸配列中に認められる小さい構造部分を指す言葉です。一般的なタンパク質は構造として球状を取りますが、タンパク質を球状にするための二次構造の結び付け方は限られています。そのため、互いに関係のないタンパク質間でヘリックス・ターン・へリックス等の一定の構造が良く出現し、そのような構造のことを構造モチーフと呼びます。また、それをコードするアミノ酸配列には特徴的なパターンがあり、その局所的に保存されたブロックにより定義されるものを配列モチーフと呼びます。*3
モチーフの種類*4*5 †
- ααモチーフ
- βヘアピンモチーフ
- βαβモチーフ
- ギリシャキーモチーフ
*1生体分子構造論: http://www.nusr.nagoya-u.ac.jp/WatanabeLab/Lectures/BioMolStruct/BioMolStruct_4.pdf
*2The Futaki Lab: 細胞機能・遺伝子を制御する生理活性蛋白質の創製: http://www.scl.kyoto-u.ac.jp/~bfdc/project03_2011.html
*3東大農学部 生物情報工学研究室 清水謙多郎 モチーフ検索: http://www.bi.a.u-tokyo.ac.jp/~shimizu/bio/motif.htm
*4生化学・講義補助資料「タンパク質の三次元構造」: http://www.bio.tottori-u.ac.jp/~mizobata/14-Seika1-protein_structure.htm
*5細胞骨格を形成するタンパク質: http://www10.showa-u.ac.jp/~biolchem/H20-P2protein-1.pdf
*2The Futaki Lab: 細胞機能・遺伝子を制御する生理活性蛋白質の創製: http://www.scl.kyoto-u.ac.jp/~bfdc/project03_2011.html
*3東大農学部 生物情報工学研究室 清水謙多郎 モチーフ検索: http://www.bi.a.u-tokyo.ac.jp/~shimizu/bio/motif.htm
*4生化学・講義補助資料「タンパク質の三次元構造」: http://www.bio.tottori-u.ac.jp/~mizobata/14-Seika1-protein_structure.htm
*5細胞骨格を形成するタンパク質: http://www10.showa-u.ac.jp/~biolchem/H20-P2protein-1.pdf
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このページの最終更新日時: 2018-03-19 (月) 10:27:46