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タンパク質中のトリプトファンが腸内細菌により代謝されて生じる芳香族化合物。インドールのメチル化誘導体であり、3-メチルインドールとも。糞便に含まれ、悪臭がある。動物実験では、スカトールの摂取により大腸においてデオキシコール酸の産生の増加、PPARγの発現低下、糞便中インドール濃度の増加を引き起こすため、炎症性腸疾患や大腸がんの一因となる可能性が示唆されている。
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