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核質に存在し、メッセンジャーRNA（mRNA）の転写を担当するRNAポリメラーゼ。hnRNAやsnRNAを合成する。PolⅡやRNAPⅡとも。RNAポリメラーゼⅡがRNAを転写伸長する過程で様々な要因で一時停止する。一時停止したRNAポリメラーゼⅡがRNA合成を再開するためには転写伸長因子が必要。DSIFおよびNELFは協調してRNAポリメラーゼⅡに作用し、転写伸長を一時停止させる活性を持つ。

ヌクレオチド除去修復の初期段階において、DNAの損傷部分を発見する役割を持つタンパク質。塩基対に異常が起きた部分に結合する。色素性乾皮症の原因遺伝子のひとつ。XPCが結合した部分が損傷であるかどうかを確認するのはXPDの役割である。

真核生物は原核生物と異なり、RNAポリメラーゼ単独ではなく基本転写因子と呼ばれる一群のタンパク質が転写に必要となる。3種類のRNAポリメラーゼ（Ⅰ〜Ⅲ）のそれぞれに対応する基本転写因子がある。-RNAポリメラーゼⅡの基本転写因子--TFⅡA--TFⅡB--TFⅡD--TFⅡE--TFⅡF--TFⅡH

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