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HEALTH WORDS / 用語解説

Go

Go

Goとは、一般的にプログラミング言語の「Go言語(Go)」を指すことが多いが、健康関連・生命科学の文脈においては、遺伝子オントロジー(Gene Ontology)の略称として用いられる。遺伝子オントロジー(Go)とは、生物学的なドメインにおいて、遺伝子および遺伝子産物の機能を包括的に記述するための標準化された語彙の集合である。Gene Ontology Consortiumによって開発・維持されており、バイオインフォマティクスやゲノム科学の分野において遺伝子の機能注解やデータ解析に広く利用されている。1

遺伝子オントロジー(Go)の枠組みでは、遺伝子の機能を大きく3つのオントロジー(ドメイン)に分類して記述する。1つ目は、遺伝子産物が細胞内で活性を発揮する場所を示す「細胞成分(Cellular Component)」である。2つ目は、酵素触媒 活動や受容体 結合など、分子レベルでの遺伝子産物の活動を指す「分子機能(Molecular Function)」である。3つ目は、分子、細胞、組織などの活動が組み合わさって達成される、より高次な生物としての目的を持ったプロセスを示す「生物学的プロセス(Biological Process)」である。これらの用語はそれぞれ階層的な構造を持って定義されている。2

生物医学研究や網羅的解析、例えばマイクロアレイや次世代シーケンサを用いたトランスクリプトーム解析などにおいて、遺伝子オントロジー(Go)を用いたエンリッチメント解析(過剰表現解析)は不可欠な手法となっている。これにより、特定の実験条件で変動した多数の遺伝子群の中に、どのような生物学的プロセスや分子機能に関連する遺伝子が統計的に有意に集積しているかを客観的に評価することができる。また、モデル生物間での遺伝子機能の比較や、統合データベースを通じた生物学的知識の横断的な検索および解釈を可能にする基盤としても機能している。3

参考文献・出典

  1. Gene Ontology: https://geneontology.org/ ↩
  2. Gene Ontology Consortium: https://geneontology.org/docs/ontology-documentation/ ↩
  3. National Center for Biotechnology Information: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4086060/ ↩