基礎生物学
基礎生物学とは、生物の生命現象に関する普遍的な原理や仕組みを科学的に探求する学問分野の総称である。 地球上に存在する多様な生物が共有する共通祖先からの進化の歴史を紐解きつつ、分子、細胞、個体、そして生態系に至るまでの各階層における生命の維持機構を解明することを目的としている。
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基礎生物学とは、生物の生命現象に関する普遍的な原理や仕組みを科学的に探求する学問分野の総称である。 地球上に存在する多様な生物が共有する共通祖先からの進化の歴史を紐解きつつ、分子、細胞、個体、そして生態系に至るまでの各階層における生命の維持機構を解明することを目的としている。
以下の2つの意味がある。
変異データとは、ゲノム上の塩基配列における置換、欠失、挿入などの変異に関する情報を組織的に記録したデータのことである。
強力なプロモーターとは、RNAポリメラーゼの結合頻度や転写開始効率が非常に高く、下流にある遺伝子のmRNAへの転写量を飛躍的に増大させるプロモーターのことである。遺伝子工学やタンパク質発現系において、目的とするタンパク質を効率よく大量に生産するために不可欠な要素として広く利用されている。
復元とは、生物学、医学、生態学などの分野において、損傷を受けた組織、器官、細胞、あるいは生態系が、その構造や機能を元の状態に戻す、あるいは戻すことのできる生体の現象や人為的なプロセスの総称である。 医学や生物学の文脈では、主に組織の再生やDNAの修復、さらには細胞レベルでの構造的・機能的な回復を指して…
欠失とは、染色体やDNAの塩基配列の一部が失われる突然変異の一種である。
DNAの塩基配列の一部が欠損する突然変異。欠失突然変異とも呼ばれる。放射線などによって引き起こされる。
次世代シーケンシングとは、従来法であるサンガー法と比較して、圧倒的に多数のDNA分子の塩基配列を同時に、かつ超高速で決定することができる一連のDNAシークエンサー技術の総称である。
DNAを構成する塩基配列(アデニン、グアニン、シトシン、チミン)の並びが一つ変化する突然変異。
生化学的特性とは、生体物質、細胞、組織、あるいは生体システムが持つ化学的な性質および生化学的な振る舞いの総称である。 これにはタンパク質や核酸などの生体高分子の構造的安定性、酵素による触媒活性、代謝経路における反応性、および分子間相互作用などが含まれる。
癌化とは、正常な細胞が遺伝子変異やエピジェネティックな異常の蓄積により、無秩序な増抗と浸潤・転移能を獲得するプロセスのことである。 生物学的な細胞は通常、精緻な細胞周期の制御を受け、周囲の組織環境と協調して生存している。 しかし、様々な内因性あるいは外因性の要因によってDNAの塩基配列に傷がつき、それが…
直線状DNAとは、両端が遊離した末端を持つDNAの分子構造の形態を指す。 真核生物の核内に存在する染色体のDNAや、一部のウイルスおよびバクテリオファージのゲノムにおいて一般的な構造として見出される。
2つのDNA分子が相同性を有する際、その部分で分子の組み換えが起こり、新しい分子が生じる現象普遍的組換えとも呼ばれる。生殖細胞の減数分裂や体細胞の細胞分裂で起こる。
相補的とは、2つ以上の要素が互いに不足している部分を補い合うことで、全体として完全な機能や構造を形成する性質を指す用語である。
真核微生物とは、細胞内に核や細胞小器官を持つ真核生物のうち、微生物として扱われる単細胞生物および一部の多細胞生物の総称である。
ゲノムの特定の塩基配列がコピーされ、これが再びゲノムに挿入されたレトロトランスポゾン。生物進化の過程において、ある生物のゲノムの特定の場所にSINEが挿入されると、これが子孫に受け継がれる。
祖先遺伝子とは、進化の過程において、現代の複数の遺伝子やゲノム領域が分岐・複製するもととなった、過去の生物種が保有していた遺伝子のことである。
遺伝子であるDNAの塩基配列の変化のこと。単に変異とも呼ばれる。
第一減数分裂とは、有性生殖を行う生物の生殖細胞形成過程において見られる、減数分裂の最初の細胞分裂段階のことである。
系統発生とは、生物の集団や種が地質学的な時間の経過とともに進化し、分岐・適応してきた歴史的な過程およびその系統関係の全体像を指す生物学の基本概念である。
組換えDNAとは、人工的な遺伝子操作技術を用いて、異なる生物由来のDNA分子をつなぎ合わせた新しいDNA分子のことである。
網羅的ゲノム解析とは、生体におけるゲノム情報の全体像を系統的かつ包括的に解明するための一連の解析手法およびアプローチの総称である。 従来の手法が特定の遺伝子や限られた塩基配列の変異に焦点を当てていたのに対し、本手法ではDNAやRNAの全領域を対象として網羅的なデータ取得を行う点に大きな特徴がある。
線形動物門に属する動物の総称。一般的な線虫は体長1mm程度の細長い体を持つ。
自律複製とは、生体の遺伝情報を担う核酸や細胞などが、他の分子や細胞の恒常的な介入や制御を直接受けずに、自らの系の中で複製を進める現象および仕組みのことである。
複合体とは、複数の分子、原子、または細胞などの構成要素が、非共有結合あるいは共有結合などの相互作用によって結合し、全体として一つのまとまった機能単位を形成しているものの総称である。 生物学や医学の分野においては、単一のタンパク質単体では発揮できない多様な高次機能を担うタンパク質複合体や、核酸とタンパ…
転写因子SP1とは、哺乳類の遺伝子発現調節において中心的な役割を果たすDNA結合タンパク質であり、主にプロモーター領域に存在するGCリッチ配列に結合して転写を活性化するジンクフィンガー型の転写因子である。
転写因子複合体とは、真核生物の遺伝子発現において、転写因子や関連するタンパク質が相互に結合して形成する多量体構造のことである。 この複合体はDNA上の特定の塩基配列であるプロモーター領域やエンハンサー領域に特異的に結合し、RNAポリメラーゼによる転写の開始やその効率を精密に制御する中心的な役割を担っている…
転写抑制因子とは、DNAからmRNAへの転写を負に調節し、遺伝子発現を抑制あるいは停止させるタンパク質の総称である。
転写産物とは、DNAの遺伝情報がRNAポリメラーゼなどの酵素によってRNA分子へと転写されたものの総称である。
転写開始前複合体とは、真核生物においてRNAポリメラーゼIIなどのRNAポリメラーゼが遺伝子のプロモーター上に正確に結合し、転写を開始するために形成される巨大なタンパク質複合体である。
近縁種とは、進化的な系統において比較的最近に共通の祖先から分岐した、分類学的に近い関係にある生物同士の種を指す用語である。
mRNAスプライシングのひとつ。
DNA断片の塩基配列の差異を個体間の遺伝的な違いを表す手がかりや遺伝的な意味での単なる記号として用いる個々の変異。
遺伝情報を表すDNAの塩基配列の一部のこと。生物の性質は遺伝子により親から子へ引き継がれる。
遺伝子コードとは、DNAまたはRNAの塩基配列が持つ遺伝情報を、タンパク質を構成するアミノ酸の配列へと変換するための対応関係の規則である。
遺伝子内の塩基配列の一部が複製や除去を受けることによって、多様な塩基配列を持つ遺伝子がもたらされること。
遺伝子に記述された塩基配列の情報からタンパク質を合成すること。単に発現と呼ばれる場合が多い。
DNAの塩基配列を操作すること。
遺伝的制御とは、生物における遺伝子の発現量を調節し、細胞の機能や状態を時間的および空間的に統御する生体内の仕組み全般を指す。
遺伝的基盤とは、生物の形質、表現型、あるいは特定の疾患や形質の発現を規定する、遺伝子およびゲノム上の塩基配列全体の仕組みを指す言葉である。生物科学および医学の分野において、個体の多様性や遺伝性疾患の病因を分子レベルで理解するための基礎概念として位置づけられている。すべての生物はDNA(一部のウイルスで…
遺伝的距離とは、集団間あるいは個体間における遺伝子的な差異の大きさを定量的に表した指標である。 生物の進化的な系統樹の構築や、集団遺伝学における遺伝的変異の解析において中心的な役割を果たしている。
非LTR型レトロトランスポゾンとは、両端に長末端反復配列(LTR)を持たないレトロトランスポゾンの一種であり、ゲノム上の別の場所へ移動する際にRNA中間体を介して逆転写機構を利用する可動遺伝因子である。
相同性のないDNA間あるいは短い相同配列間で起こるDNA塩基配列の組換え。原核生物から真核生物に至る全ての生物種で起きる現象とされる。染色体異常の原因となることが知られている。